使用活性污泥的厌氧池也会发生钙化现象，但由于结构不同，钙化的部分无法形成一个规则的形状，所以造成的视觉效果不太明显，只会让人感觉污泥颜色怎么变浅了。

在钙化情况比较严重的颗粒污泥里，微生物会逐渐老化死亡，最后变成中空状的钙质小球，对生厌氧反应器的影响很大，有时候甚至需要停止进水，对工厂的生产十分不利。